bioinfo

    Bioinformatika

    Az adatbányászati feladatok megoldása során szerzett tapasztalatainkat biológiai adatok feldolgozásakor is alkalmazzuk. A hatalmas méretű biológiai adathalmazok feldolgozása speciális algoritmusokat és hatékony számítási környezet igényel.

    Markov Chain Monte Carlo for metabolic networks

    Az anyagcsere-hálózatok folyamatosan változnak, evolválódnak. Ezeket a folyamatokat modellezzük egy Monte Carlo Markov Chain sztochasztikus rendszerben.

    Reticular Alignment: hatékony iteratív szekvenciaillesztés

    A Reticular Alignment modul egy hatékony iteratív szekvenciaillesztő algoritmust valósít meg. A korábbi sarok-levágó módszerekkel ellentétben a dinamikus programozási táblának nem egy konvex részét választja ki, hanem egy olyan illesztési hálózatot amely nem csak az optimális, hanem a legjobb szub-optimális útvonalakat is tartalmazza.

    Kismolekula hasonlóság modellezés, Richter


    Kismolekula hasonlóság modellezés illetve molekulák klaszterezése a Richter Gedeon Rt. részére, 2004-2006.

    A molekulák jól leírhatók egy címkézett gráffal. A gráfos reprecentáció azonban kevéssé alkalmas arra hogy gyorsan számíthassunk hasonlóságot a molekulák között. Ujjlenyomat-modellek alkalmazásával azonban jelentősen hatékonyabban megoldható a feladat.